ftpのサブコマンドとしてmputコマンドがあります。
mputコマンドは、第一引数で指定した複数ファイルをftpサーバ側ディレクトリにコピーするコマンドです。
この時、ファイル名にはワイルドカードが使用できます。
使用方法は

mput ローカルファイル名