java.io.BufferedReaderクラスのreadLine()メソッドでファイルの内容を1行読み込むことが可能です。
以下、例です。

import java.io.BufferedReader;
import java.io.FileInputStream;
import java.io.IOException;
import java.io.InputStreamReader;

public class Test{
    public static void main(String[] args) {
        FileInputStream fis            = null;
        BufferedReader readFile    = null;
        
        try {
             fis = new FileInputStream("c:¥¥test1¥¥test2¥¥a.txt");
            readFile = new BufferedReader(new InputStreamReader(fis, "Shift_JIS"));
        } 
        catch(Exception e) {
            e.printStackTrace();
        }
        
        String line;
        try {
            while((line = readFile.readLine()) != null) {
                System.out.println(line);
            }
        } catch (IOException e) {
            e.printStackTrace();
        }finally{
            try {
                fis.close();
                readFile.close();
            } catch (IOException e) {
                e.printStackTrace();
            }
        }
    }
}

c:¥test1¥test2¥a.txtファイルを読み込み、readLine()メソッドで1行ずつ読み込んで標準出力しています。