改行コードは特殊文字として <#CR> であらわします。
以下の例は、ファイルをオープンし、aと入力して改行した後にbを入力している例です。

fid = FOPEN("c:¥a.txt",F_READ or F_WRITE)
FPUT(fid,&quot;a&quot; + &quot;<#CR>&quot; + &quot;b&quot;)
FCLOSE(fid)

上記例を実行し、以下のようなファイルができれば、OKです。改行コードはダブルクォーテーションで囲む必要があるので注意です。