バッチファイル中にコメントを書きたい時にはremコマンドを使用します。

rem コメント

というように書きます。コメント部分にコマンドを書いても実行されません。
コメント部分には|><が使用できないとリファレンスには書いてありますが、使用しても特に問題ないと思います。

≪remコマンドの使い方≫
@echo off
rem これはカレントディレクトリにa.txtが存在したら
rem 「exist!」と表示し、存在しなければ「not exist!」と
rem 表示するバッチファイルです。

dir | find "a.txt" > nul
if errorlevel 1 goto NOT
echo exist!
goto :EOF
:NOT
echo not exist!