バッチファイルをexeに変換するソフトがあります。bat to exe Converterというソフトでこちらからダウンロードできます。
起動すると以下の画面が開きます。



Batch file欄にバッチファイルを指定します。そのままexeも同じ形式で設定されます。
「Invisible application」にするとバッチファイルが表示されずに実行されます。