「ファイル」 - 「別名保管」を選択すると現在開いているファイルを別名保管するウィンドウが表示されます。



javaエディターがアクティブでなくても、現在開いているファイルが対象になります。
上図の「ファイル名」欄に別名を入力し、「OK」をクリックします。
すると、「親フォルダーを入力または選択してください」欄で指定したフォルダ配下に別名でファイルが保存されます。