XMLタグの要素を全削除するサンプルです。ファイル名だけ変更して、コピーして使えます。

import java.io.BufferedReader;
import java.io.FileReader;
public class test{
    public static void main(Sting[] args){
        try{
            FileReaer f = new FileReader("c:¥¥a.txt");
            BufferedReader b = new BufferedReader(f);
            String s;
            while((s = b.readLine()) != null){
                System.out.println(s.replaceAll(">.*<","><");
            }
        }catch(){
            System.out.println("ファイル読込失敗");
        }
    }
}