<Directory>ディレクティブでは、指定したディレクトリとサブディレクトリに対して、別のディレクティブを適用できます。
記述方法は以下のようにします。

<Directory /usr/local/Apache2/htdocs>

</Directory >

ここで指定するパスは、サーバルート配下にします。
サーバルート外を指定する場合は<Location>ディレクティブを使用します。

<Location>ディレクティブについては こちら をご覧下さい。