rmdirは、ディレクトリを削除するコマンドです。
使用方法は

rmdir ディレクトリ名

というように実行するとカレントディレクトリに存在するディレクトリが削除されます。
この時、ディレクトリ配下に何かファイルなどが存在すれば、ディレクトリの削除に失敗します。
ディレクトリごと削除したい場合はrmを使用してディレクトリごと削除することができます。